Vele moderne missies in Assassin's Creed IV: Black Flag zijn optioneel
In de Assassin's Creed-games vinden sommige spelers het een beetje jammer dat de sfeer soms gebroken wordt door terug te keren naar de hedendaagse wereld voor andere spelelementen, in het verleden met Desmond. Ook in Assassin's Creed IV: Black Flag zal men blijkbaar af en toe naar het heden terugkeren, maar dat zou slechts weinig gebeuren.
Ubisoft laat immers weten dat "de fans die echt gek zijn van die zaken, heel wat content kunnen vinden die ermee te maken heeft. Het is zowat een hommage aan onze fans, door de geschiedenis van de franchise verder uit te diepen. De content in de hedendaagse wereld is volledig optioneel, dus als het je niet interesseert, geen probleem. Je moet het niet spelen", zegt Ashraf Ismail (director). Je komt echter wel te weten wat er met Desmond gebeurt na AC III. Het lijkt dus dat de moderne missies grotendeels hetzelfde te verlopen als de zeemissies uit Assassin's Creed III.